Composto por acervos dos sítios arqueológicos das ocupações indígenas pré-coloniais do Vale do Taquari e Rio Grande do Sul, como cerâmica, lítico e arqueofauna e acervos históricos do período colonial, como vidros, louças e metais.
O acervo arqueológico do Museu de Ciências Univates é composto por evidências de ocupações humanas pré-coloniais e coloniais, abrangendo coleções de cerâmica, lítico, restos faunísticos, louças, vidros e metais. Inclui materiais dos sítios arqueológicos das ocupações indígenas pré-coloniais do Vale do Taquari e do Rio Grande do Sul, como cerâmica, lítico e arqueofauna, além de acervos históricos do período colonial, com vidros, louças e metais.