Fundado em 2001, o Laboratório de Arqueologia do Museu de Ciências da Univates é referência em pesquisa e educação patrimonial no Vale do Taquari. Vinculado ao curso de História e aos Programas de Pós-Graduação em Ambiente e Desenvolvimento e em Ensino, investiga as relações entre paisagem, sociedade e cultura ao longo do tempo. Seus projetos abordam desde a ocupação humana no sul do Brasil, com foco na diversidade étnica e nas transformações geoambientais, até temas como história urbana e rural, espaços educativos não escolares, relações étnico-raciais e processos históricos do século XVII ao XXI. O laboratório também realiza ações educativas, como o projeto Arqueólogo por um dia, que aproxima estudantes da educação básica do patrimônio arqueológico regional. Reconhecido por instituições como IPHAN, CAPES e CNPq, o laboratório destaca a importância da arqueologia em diálogo com outras áreas para construir narrativas plurais, enraizadas no território e sensíveis à diversidade e aos desafios ambientais atuais.