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Detalhes do Projeto de Pesquisa

Estudos experimentais e computacionais aplicados a doenças negligenciadas

Coordenação: Luis Fernando Saraiva Macedo Timmers

Pesquisadores:
Luis Fernando Saraiva Macedo Timmers
 
Fernanda Majolo

Órgãos Financiadores:
Fundação Vale do Taquari de Educação e Desenvolvimento - FUVATES
 

Resumo:
As doenças negligenciadas, apesar muitas apresentarem tratamento, ainda são uma das principais causas de morte em países subdesenvolvidos. Devido ao desinteresse de empresas farmacêuticas no desenvolvimento de medicamentos para essas enfermidades, é de extrema relevância o estudo de novas abordagens terapêuticas que possam auxiliar no tratamento de doenças negligenciadas. Com isso, um melhor entendimento sobre os seus mecanismos de infecção, persistência e evolução tornam-se etapas limitantes para o desenvolvimento de métodos diagnósticos mais eficientes, assim como, na identificação de novos alvos moleculares para a busca de novos fármacos. O presente projeto de pesquisa tem como objetivo combinar abordagens experimentais e computacionais para a compreensão, prevenção e identificação de novos alvos terapêuticos aplicados a doenças negligenciadas. A ideia central é realizar experimentos de biologia molecular básica e biofísica molecular computacional para a proposição de novas moléculas, que possam atuar como moduladores da atividade enzimática, para proteínas envolvidas nos processos de infecção e/ou virulência.
 
Sub projetos
Coordenação: Luis Fernando Saraiva Macedo Timmers
Pesquisador(a):

Gaby Renard

Jocelei Maria Chies

Rafael Andrade Caceres

José Fernando Ruggiero Bachega

Henrique Bunselmeyer Ferreira

Jeferson Camargo de Lima

Giandra Volpato 


Fontes Financiadoras:

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul - FAPERGS


Resumo:

O presente projeto visa a aplicação de uma abordagem multidisciplinar para a predição do secretoma de Ideonella sakaiensis e a produção das proteínas recombinantes PET hidrolase e MHETase mutantes, com atividade catalítica e estabilidade térmica, para serem utilizadas co-imobilizadas, visando facilitar o processo de biodegradação, bem como propiciar a formação de produtos de valor agregado derivados da biodegradação do PET.

Coordenação: Luis Fernando Saraiva Macedo Timmers
Pesquisador(a):

Guilherme Liberato da Silva

Liana Johann

Fernanda Majolo

Márcia Inês Goettert

Rodrigo Gay Ducati

Débora Bublitz Anton

Luiz Augusto Basso

Cristiano Valim Bizarro

Pablo Machado


Fontes Financiadoras:

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul - FAPERGS


Resumo:

Os ácaros são uma das principais fontes de alérgenos, sendo os responsáveis pelo desenvolvimento da inflamação tecidual crônica tanto na asma como na rinite alérgica. Os alérgenos são glicoproteínas que apresentam proteases de cisteína na qual são produzidas por células do trato intestinal dos ácaros. A imunoterapia específica para alérgenos (IT) é a única terapia modificadora de doença alérgica disponível para crianças e adultos, e alérgenos recombinantes são uma abordagem interessante para melhorar o diagnóstico de alergia e IT. Tyrophagus putrescentiae é um ácaro comum que produz alérgenos potentes e possui proteínas alérgicas Tyr p 2 e Tyr p 3 como um dos principais gatilhos alérgicos. A exposição contínua a alérgenos pode levar o indivíduo a desenvolver inflamação persistente na via aérea, levando ao remodelamento do tecido devido à fibrose subepitelial, espessamento da musculatura lisa, depósito de colágeno e hiperplasia das células. Diante disso, este projeto tem como objetivo avaliar o efeito de diferentes proteínas recombinantes alergênicas (Tyr p 2 e Tyr p 3) em comparação com o extrato bruto comercial sobre o desenvolvimento de resposta celular alérgica in vitro sobre macrófagos murinos (RAW 264.7) e em sangue total coletados de pessoas acometidas por asma alérgica, rinite ou dermatite atópica. Serão coletados aproximadamente 10 ml de sangue de três pacientes que apresentam diagnóstico médico de doenças respiratórias ou alérgicas como asma, rinite ou dermatite atópica no Centro Clínico da Universidade do Vale do Taquari/RS. A partir do sangue periférico coletado será quantificado a concentração plasmática de IL-4 e IgE, pela técnica de ELISA, quando expostos a diferentes tratamentos e combinações (Tyr p 2; Tyr p 3; Tyr p 2+Tyr p 3; extrato comercial de Tyrophagus putrescentiae como comparação). Como meta final, o projeto pretende desenvolver proteínas recombinantes que tenham funcionalidade em futuras ferramentas de imunoterapia.

Coordenação: Luis Fernando Saraiva Macedo Timmers
Pesquisador(a):
Marcia Inês Goettert
 
Fernanda Majolo
 
Rodrigo Gay Ducati
 
Débora Bublitz Anton
 
Maria Luiza Zvirtes
 
Frantiesco Valgoi
 
Andressa Candaten Siqueira
 
Rafael Andrade Caceres
 
José Fernando Ruggiero Bachega
 
Fernanda Bueno Morrone
 
Luiz Augusto Basso
 
Pablo Machado
 
Cristiano Valim Bizarro
 
Dennis Russowsky
 
Stefan Laufer 

Fontes Financiadoras:

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq


Resumo:

A COVID-19, doença causada pelo novo coronavírus SARS-CoV-2, desde o final do ano de 2019 vem causando a morte de milhões de pessoas ao redor do mundo. Até o momento, não existe um fármaco antiviral específico contra esse coronavírus, o que dificulta a eficácia dos tratamentos e possibilita que pessoas continuem adoecendo em decorrência da doença. Aliado a isso, têm-se observado que a COVID-19 pode evoluir para uma fase inflamatória, na qual ocorre inflamação exagerada nos pulmões e ativação da tempestade de citocinas. Nessa fase, podem ocorrer diversas complicações em outros órgãos e agravamento do quadro clínico dos pacientes, sendo, portanto, uma fase crítica que determina a sobrevivência dos infectados. Diversos estudos vêm sendo realizados com diferentes proteínas do SARS-CoV-2 com o intuito de encontrar potenciais alvos terapêuticos para a COVID-19. Entre elas está a 3CL protease (3CLpro), uma enzima responsável por clivar as poliproteínas virais formadas a partir da tradução do RNA, liberando as proteínas não-estruturais essenciais para a replicação viral. Além disso, a 3CLpro foi relatada como um possível antagonista do sistema imune humano, pois ela pode atuar em vias de sinalização que dificultam a resposta antiviral à infecção. Tendo em vista que a inibição da atividade enzimática da 3CLpro pode diminuir a replicação do SARS-CoV-2 e aumentar as respostas imunológicas, inibidores dessa enzima possuem potencial para serem utilizados como tratamentos farmacológicos para a COVID-19. Com o objetivo de buscar por potenciais compostos inibidores para essa enzima que atuem como antivirais e anti-inflamatórios, neste projeto serão realizados estudos estruturais, enzimáticos e celulares envolvendo a 3CLpro de SARS-CoV-2. A primeira etapa consistirá na aplicação de métodos computacionais e ensaios enzimáticos com a proteína 3CLpro recombinante. O potencial antiviral e anti-inflamatório dos compostos que apresentarem maior afinidade pela proteína 3CLpro, serão avaliados em modelos celulares in vitro. Espera-se que com este estudo seja possível identificar um composto inibidor da proteína 3CLpro com ação antiviral e anti-inflamatória e, dessa forma, contribuir para as pesquisas que buscam por tratamentos para a COVID-19.